染色质科幻影视

清华大学八天内连发3篇CNS正刊；昔日“高考状元”颉伟再发Nature

8月13日，在最新一期的顶刊Nature上，清华大学颉伟带领团队与合作者报道了染色质结构的建立与胚胎超转录相互作用机制。目前在哺乳动物早期胚胎中，染色质组织结构如何建立，以及其与转录过程如何相互作用仍不清楚。该研究发现，CTCF蛋白在小鼠早期发育的整个过程中均

在癌症中，肺癌和胰腺癌无疑是两块最难啃的“硬骨头”。它们的发病率和死亡率居高不下，治疗手段常常捉襟见肘。许多这类癌症的背后，都有一个共同的“主谋”——KRAS基因突变。这个突变像一个被卡住的“油门”，让癌细胞疯狂增殖，难以控制。近年来，针对特定KRAS突变（如

由于染色质可及性在控制不同细胞类型基因表达变化方面无处不在，因此以临床上可行的方式针对这一过程是一项挑战。一种潜在的策略是更好地了解并专门针对这些基因表达变化最终实现轴突生长的下游机制。重要的是，不同的组蛋白修饰，如泛素化和类泛素化，可能共同作用或相互抵消，调

组蛋白是核小体的核心成分。核小体包裹并压缩DNA形成染色质，限制了需要DNA作为模板的细胞机制对DNA的可及性。组蛋白因此在转录调控、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中发挥核心作用。DNA的可及性通过一组复杂的组蛋白后修饰（也称为组蛋白密码）和核小体重塑来

细胞核基因组主要分为两大区域：基因丰富且相对开放的常染色质，以及基因稀少且相对致密的异染色质。随着Hi-C染色质构象捕获和染色质追踪等技术的出现，基因组的复杂层级组织结构正逐渐被揭示。每条染色体在细胞核内占据独立区域，其基因组可以人为划分为两个区室结构——A/

清华大学生命学院陈柱成团队发现人源染色质重塑蛋白 SMARCAD1 对亚核小体的偏好性，并与郗乔然团队合作验证了 SMARCAD1 这一功能对小鼠胚胎干细胞干性维持的重要作用。

转座酶切割：蛋白A/G-Tn5融合酶结合抗体后，激活的Tn5转座酶在目标位点附近同时完成DNA双链切割和测序接头插入，产生约300-500bp的靶向片段。

核小体是真核生物染色质的基本单元。经典的核小体由 147 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成，其中组蛋白八聚体由两拷贝 H2A-H2B 二聚体和一拷贝 ( H3-H4 ) 2 四聚体组成。染色质结构高度动态可塑，核小体在复制，转录，

在真核细胞中，DNA与蛋白质的相互作用构成了基因组功能调控的核心基础。DNA并非以裸露的线性分子形式存在，而是与组蛋白、RNA以及大量染色质相关蛋白共同构成高度组织化的三维空间结构。这种复杂的核内环境使得只有特定蛋白质能够在特定时间点直接接触DNA，参与调控基

染色质的空间组织结构是维持基因组稳定性、实现基因表达精准调控关键环节。在植物中，已有诸多参与调控关键农艺性状的远程调控元件被鉴定。然而，现有三维染色质构象捕获技术（如Hi-C, ChIA-PET, HiChiP和OCEAN-C等）仍难以在低成本条件下无偏好性地

编码转录因子 c-Myc 的 MYC 基因是最为常见的异常激活的原癌基因之一，其基因扩增发生在超过 50%的人类癌症中。传统观点认为MYC 蛋白通过结合启动子区域 DNA 以调控下游靶基因的转录。近年来的研究表明，部分

这种方法是最基础的免疫沉淀技术，通常使用抗体与蛋白A/G珠子结合的形式。该方法的优点在于操作简便，适用于大多数实验室环境。但需要注意的是，选择合适的抗体和珠子是成功的关键。

为解决 3D 基因组染色质拓扑结构调控因子研究受限，缺乏高效筛选技术的问题，研究人员开展了名为 Perturb-tracing 的技术研究。他们发现众多新调控因子，研究成果发表在《Nature Methods》上明确其多尺度作用及与已知机制关联，还揭示染色质压

基因组的三维空间结构调控是近年来分子生物学领域的重要研究方向。在两侧对称动物（如脊椎动物和昆虫）中，大量研究表明染色质环（chromatin loops）在基因表达调控中发挥着核心作用。这种三维结构通过将基因组上相距遥远的调控元件（如增强子）与目标基因的启动子

我们身体里形态和功能千差万别的细胞，从思考的大脑神经元到跳动的心脏肌肉细胞，都携带着同一套DNA密码本？如果基因组序列是生命的蓝图，那究竟是什么力量决定了每个细胞会“阅读”和执行蓝图中的哪些部分，最终构建出如此多姿多彩的生命？答案不仅藏在DNA的线性序列里，更